脫硫系統是為沼氣燃燒、沼氣發電等而設計的大型工藝，它根據沼氣的實際需求對沼氣進行系統的脫硫和脫水。脫硫采用物理和化學相結合，脫水采用機械和氣水分離膜技術。整個脫硫脫水處理工藝具有效率高、操作簡單、管理方便、運行成本低等優點

用于干脫硫和去除沼氣中碗狀氬（H2S）的設備的基本原理是用02將H2S氧化成硫或碗狀氧化物的方法。也可以稱為公式氧化法。干燥工藝設備由將填料放置在容器中組成，填料層包括活性炭、氧化鐵等。氣體從一端以低流速通過容器中的填料層。在硫化氫（H2S）被氧化為硫或氧化硫后，它留在填料層中。凈化后，氣體從容器的另一端排出；

濕法脫硫一般可分為物理吸收法、化學吸收法和氧化法。物理和化學方法存在硫化氫后處理的問題。氧化法使用性溶液作為吸收劑，氧載體作為催化劑，吸收H2S并將其氧化為元素硫。濕式氧化法使用脫硫劑溶解在水中，液體進入設備并與沼氣混合。沼氣中的硫化氫（H2S）與液體反應生成元素硫并吸收硫化氫，包括氫氧化鈉、二氧化碳、碳酸鈉、硫酸亞鐵等。采用成熟的氧化脫硫方法，脫硫率可達99.5%以上。在大型脫硫工程中，粗脫硫一般采用濕法，細脫硫采用干法；

生物脫硫技術包括生物過濾、生物吸附和生物滴濾。這三個系統屬于開放系統，其微生物種群隨環境變化而變化。在生物脫硫過程中，氧化硫污染物必須首先通過生物還原生成硫化物或H2S，然后通過生物氧化生成元素硫，然后才能去除。在大多數生物反應器中，細菌是主要的微生物種類，真菌是第二種，酵母很少。常用的細菌有氧化亞鐵硫桿菌、脫氮硫桿菌和脫氮硫芽孢桿菌。最成功的代表是氧化亞鐵硫桿菌，其生長pH值為2.0~2.2。